电子商业汇票的背书流程如下：
背书人登录：
背书人通过网上银行、银行柜台或其他电子终端登录，录入背书申请信息，并使用背书人的数字证书加盖电子签名。
开户行审核：
开户行审核背书人的电子签名，通过后组成背书业务申请报文，并使用开户行的数字证书加盖电子签名，然后发给人民银行的电子商业汇票系统。
人民银行审核：
人民银行的电子商业汇票系统审核开户行电子签名是否准确有效以及背书人是否是票据的持有人，审核通过后将申请报文转发至被背书人开户行的接入系统。
被背书人接收：
被背书人开户行的接入系统核验报文的有效性，并将申请信息通知或展示给被背书人。被背书人可以签收或者驳回该背书申请，并加盖自己的电子签名。
签发确认：
被背书人开户行的接入系统核验被背书人电子签名的有效性，核验通过后组成回复报文并加盖开户行的电子签名，将回复报文发往人民银行的电子商业汇票系统。人民银行电子商业汇票系统核验签收报文的有效性后，如果为同意签收的回复报文，则将票据所有人修改为被背书人并通知背书人。
建议：在实际操作中，建议严格按照上述流程操作，确保每一步都准确无误，以避免出现不必要的延误或错误。同时，确保所有参与方的数字证书和电子签名都是有效的，以保障背书过程的安全性和法律效力。