大产权房和小产权房的区别主要体现在以下几个方面：
产权归属
大产权房：购房者拥有完整的房屋所有权和相应的土地使用权，可以依法办理房屋所有权证和土地使用证（现在多为不动产权证）。
小产权房：购房者只拥有部分产权，没有国家颁发的产权证，其土地使用权流转受到严格限制，通常由乡镇政府、村集体或村民自行组织建设。
合法性
大产权房：合法合规，经过一系列严格的审批程序，包括土地出让、规划许可、施工许可以及竣工验收等环节，符合国家法律法规和相关政策的要求。
小产权房：不合法，未缴纳土地出让金等费用，缺乏完整的开发建设手续，无法取得合法的产权证书，法律层面上其产权界定较为模糊。
交易税费
大产权房：在房屋再次转让时，如果已经缴纳了土地出让金，则为大产权房，交易税费按照正常程序进行。
小产权房：如果未缴纳土地出让金，则称为小产权房，交易税费较低，但存在法律风险，且无法通过正规渠道获得产权证。
权益保障
大产权房：购房者享有广泛而坚实的权益保障，可以自由处分房产，包括出售、抵押、继承等，并且在面临房屋质量问题、开发商违约等情况时，能够通过合法途径维护自己的权益。
小产权房：购房者权益保障较弱，无法享受与商品房同等的法律保护和市场认可，且在拆迁、转让等方面存在诸多限制和风险。
综上所述，大产权房和小产权房在产权归属、合法性、交易税费和权益保障等方面存在显著差异。大产权房受到法律保护，可以自由交易；而小产权房则存在法律风险，交易受限。建议购房者在购买房产时，务必了解清楚房产的产权性质和相关法律法规，以保障自身权益。