云南自由行最佳路线有以下几种推荐：
经典西北线：
昆明—大理—丽江—香格里拉—泸沽湖。这条线路涵盖了云南最经典的景点，适合第一次来云南的游客，体验从大理的洱海、苍山、古城，到丽江的古城、玉龙雪山，再到香格里拉的普达措国家公园、松赞林寺和泸沽湖的摩梭文化等多样风情。
滇西环线：
昆明—大理—丽江—腾冲—德宏（瑞丽）。这条线路不仅包含了云南西部的主要景点，还可以延伸到缅甸和老挝边境，适合希望深入了解当地文化和地理多样性的游客。
滇南热带雨林线：
昆明—玉溪—普洱—西双版纳。这条线路适合喜欢自然探索的游客，可以游览云南储水量最大的抚仙湖、普洱茶故乡普洱以及独特的热带雨林景观。
滇东南喀斯特地貌线：
昆明—石林—红河（弥勒、建水、蒙自、元阳）。这条线路适合喜欢自然景观和地质奇观的游客，可以游览世界罕见的喀斯特地貌——石林，以及元阳梯田等壮丽的自然景观。
昆明—东川红土地—罗平油菜花—普者黑—坝美。这条线路适合喜欢摄影和自然风光的游客，可以捕捉到东川红土地、罗平油菜花、普者黑和坝美的独特美景。
根据你的旅行时间和兴趣，可以选择以上一条或多条线路进行组合，以达到最佳的旅行体验。如果预算和时间允许，建议选择包含多个景点的线路，以便更全面地体验云南的美丽风光和丰富文化。同时，考虑到云南各地的交通和住宿条件，提前规划好行程和交通方式，可以让旅行更加顺利和舒适。