加班工资的计算基数通常有以下几种确定方式：
劳动合同约定
如果劳动合同中明确约定了加班工资的计算基数，那么应当以劳动合同约定的工资数额作为计算基准。
如果劳动合同的工资项目分为“基本工资”“岗位工资”“职务工资”等，应当以各项工资的总和作为基数计发加班费，不能以“基本工资”“岗位工资”或“职务工资”单独一项作为计算基数。
实际工资
如果劳动合同没有明确约定工资数额，或者合同约定不明确时，应当以实际工资作为计算基数。实际工资包括用人单位直接支付给职工的工资、奖金、津贴、补贴等。
在确定职工日平均工资和小时平均工资时，应当按照劳动和社会保障部《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》规定进行折算。
最低工资标准
如果加班费的计算基数低于当地当年的最低工资标准，应当以日、时最低工资标准为基数。
集体合同
劳动合同没有约定的，按照集体合同约定的加班工资基数以及休假期间工资标准确定。
法院裁定
在实际发放的工资高于原约定的工资标准时，应以实际发放的工资作为加班费的计算基数。
如果工资系打包支付，或双方形式上约定的“正常工作时间工资”标准明显不合理，或有证据证明用人单位恶意将本应计入正常工作时间工资的项目归入非常规性奖金、福利性、风险性收入等项目中，以达到减少正常工作时间工资数额计算目的的，可参考实际收入*70%的标准进行适当调整。
建议
明确约定：用人单位和劳动者应当在劳动合同中明确约定加班工资的计算基数，以避免后续的争议。
实际发放工资：如果劳动合同没有明确约定，用人单位应当以实际发放的工资作为计算基数，并确保计算过程中包括所有应计入的工资项目，扣除不应计入的项目。
遵守法律规定：用人单位在确定加班工资计算基数时，应当遵守相关法律法规，确保计算结果的合法性和公平性。
以上内容仅供参考，具体操作时还需结合当地的具体规定和实际情况。