在《封神演义》中，元始天尊和通天教主都是鸿钧老祖的弟子，修为均为大罗金仙水准，但元始天尊作为大弟子，其修为在通天教主之上。从多个角度来看，元始天尊的实力均强于通天教主：
个人修为：
元始天尊被认为是三清之首，其修为和法力在封神演义中多次展现，尤其是他手持的盘古幡，具有开天辟地之威，能够抵挡通天教主的诛仙剑气。
法宝：
虽然通天教主拥有众多强大的法宝，如诛仙四剑、鱼骨紫电锤、穿心锁、六魂幡等，但元始天尊的法宝同样不容小觑，尤其是他的万朵金莲和庆云，都是极为强大的防御手段。
战斗表现：
在封神大战中，元始天尊多次与通天教主交手，虽然在诛仙阵中一度被削去顶上莲花，但总体上他能够联合其他圣人破阵，显示出其综合实力仍强于通天教主。
地位与影响力：
元始天尊作为阐教的掌教圣人，在道门中的地位尊崇无比，其教义和影响力也远大于通天教主。
综上所述，虽然通天教主在某些方面表现出色，但从整体实力、法宝和战斗表现来看，元始天尊的实力更胜一筹。