药不然之所以帮老朝奉，主要有以下几个原因：
洗清爷爷的冤屈：
药不然的爷爷药慎行是第一任老朝奉，当年因受日本人威胁而被迫成为老朝奉，他这么做是为了暗中保护文物。药不然不相信爷爷是汉奸，因此想打入古董造假集团内部调查真相，为爷爷洗清冤屈。
捣毁老朝奉的赝品帝国：
药不然加入老朝奉的阵营，也是为了帮助许愿，两人里应外合才能摧毁造假集团。
取得老朝奉的信任：
药不然通过帮助老朝奉做了很多坏事，逐渐取得了老朝奉的信任，从而能够从内部瓦解老朝奉的实力。
寻找太爷爷的遗骨：
药不然出身鉴古学会五脉之一的玄字门药家，他帮助老朝奉也是为了寻回太爷爷的遗骨，并为他洗刷汉奸的污名。
共同的目标：
药不然和老朝奉实际上有共同的目标，即找回十件柴瓷，而药不然通过帮助老朝奉，能够更自由地采取行动，尤其是在面对老朝奉的谨慎性格时。
综上所述，药不然帮老朝奉是出于多重原因，包括为爷爷洗清冤屈、捣毁老朝奉的赝品帝国、取得老朝奉的信任、寻找太爷爷的遗骨以及两人有共同的目标。尽管药不然表面上投靠了老朝奉，但他实际上一直在暗中帮助许愿，最终成功摧毁了老朝奉的势力，并洗白了爷爷的冤屈。