《沉默的真相》的结局中，严良在保护张晓倩回程的路上，与卡恩集团展开了激烈的斗争。卡恩集团虽然处于劣势，但仍试图绑架张晓倩。警方最终成功捕获了全部犯人，并护送了人证。嫌疑人孙传福畏罪自杀，而朱伟、张超、陈明章等参与抛尸案的人被判刑七年。侯贵平死亡的真相也得以揭露。
在结局部分，张晓倩出面检举了恶势力，江阳以死鸣冤最终得以平反。孙传福等人得知张晓倩经由严良护送，试图在回程途中阻止她，但警方与他们的激烈枪战最终导致了胡一浪的死亡。赵伟民再次联系省厅领导召开专项大会，张晓倩首次以李雪的身份出现在众人面前，她坦言当年目击了侯贵平拒绝丁春妹并将其强行推出门的过程。
此外，剧中还涉及了其他情节，如夏立平的自杀、赵铁民的违纪行为以及严良给老陈的遥控器等，但这些情节对主要剧情的影响较小。
总的来说，《沉默的真相》的结局是正义最终得以伸张，真相大白。