启动子和起始密码子在遗传信息的表达过程中扮演不同的角色，它们有以下区别：
本质不同
启动子：是DNA上的一段碱基对序列，位于转录起始位点的上游，是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的区域。启动子本身不被转录成RNA。
起始密码子：是mRNA上相邻的三个碱基，位于开放阅读框架区，是翻译开始的信号，用于指示蛋白质合成的起始位置。
作用不同
启动子：能够活化RNA聚合酶，使其与模板DNA准确结合并具有转录起始的特异性，控制基因转录的起始时间和程度。
起始密码子：在翻译过程中起作用，标志着多肽链合成的开始，并编码第一个氨基酸（通常是甲硫氨酸）。
在遗传信息表达中起作用的时刻不同
启动子：在DNA转录时起作用，是转录过程的起始点。
起始密码子：在DNA翻译时起作用，是翻译过程的起始点。
总结：
启动子和起始密码子虽然都是遗传信息表达过程中的关键元素，但它们在DNA和RNA的不同阶段发挥作用，分别控制转录和翻译的起始。启动子位于DNA上，是RNA聚合酶识别和结合的区域；起始密码子位于mRNA上，是翻译开始的信号。