工程审计的内容主要包括以下几个方面：
项目立项与规划审计
立项合规性审查：审查项目立项的合法性和合理性，确保项目符合国家政策、法规及行业标准。
规划审计：检查项目规划、设计方案是否符合技术标准和行业规范，是否科学合理。
资金与预算审计
资金预算审查：核实项目预算的编制是否科学合理，资金是否充分，是否符合项目实际需求。
资金使用合规性审查：审查项目资金的使用是否严格按照预算执行，是否存在浪费、挪用或其他不合规行为。
资金支付审计：检查合同条款中关于付款、结算等方面的支付是否符合约定。
合同与招投标审计
招标审计：审查招标程序是否公开、公正，是否遵循相关法规及行业规范。
合同审计：检查项目合同是否明确权责，合同条款是否公平合理，是否对项目目标和各方责任进行了充分约定。
施工过程中的审计
工程进度与质量审计：监控工程进度，检查是否按计划推进，是否存在延误或超期现象；对施工质量进行审查，确保工程质量符合设计要求和国家标准。
变更与索赔审计：检查项目过程中是否存在未经批准的设计变更或施工变更，是否存在不合理的索赔行为。
费用审计：对施工过程中产生的费用进行审计，确保支出的合理性和合规性，避免工程款项的虚增或浪费。
验收与竣工审计
竣工结算审计：对工程竣工后的最终结算进行审计，确保结算金额的准确性与合规性，防止虚报、漏报情况。
质量验收与安全审计：对工程质量进行验收，确保工程质量符合设计要求和国家标准，同时进行安全审计，确保施工过程中的安全。
其他专项审计
决算资料审计：审查决算资料的完整性，确保竣工财务决算报表和说明书的完整性和真实性。
建设投资支出审计：审计各项建设投资支出的真实性和合规性。
交付使用资产审计：审计交付使用资产的真实性和完整性。
结余资金及基建收入审计：审计结余资金及基建收入的情况。
尾工工程审计：审计尾工工程的情况。
审计准备与后续工作
审计计划与方案：制定详细的审计计划与方案，明确审计目标、范围、方法和时间安排。
审计实施：深入施工现场，掌握工程进展、变更等真实情况，了解工程建设中涉及的有关技术问题，熟悉工程计量规则及有关费用的测算办法，并做好相关记录。
审计报告：根据审计结果编制审计报告，提出审计意见和建议，供建设单位参考。
通过以上各个方面的审计，可以确保工程项目的合法性、合规性、经济性及效益性，从而保障工程项目的顺利进行和资金的安全使用。