大产权房和小产权房的区别主要体现在以下几个方面：
合法性
大产权房：合法，拥有国家颁发的产权证，可以在市场上自由买卖和转让，且受到法律保护。
小产权房：不合法，没有国家颁发的产权证，通常由乡镇政府或村集体颁发一些形式的证明文件，但这些文件并不具备法律效力，不受法律保护。
交易税费
大产权房：交易税费较高，但在再次转让时，如果已经缴纳了土地出让金，则不需要补缴。
小产权房：交易税费较低，但由于没有缴纳土地出让金，其土地使用权的流转受到严格限制，且再次转让时需要补缴土地出让金。
产权归属
大产权房：产权归属于购房者，购房者拥有完整的房屋所有权和相应的土地使用权，可以依法进行交易、出售、抵押、继承等。
小产权房：产权归属于乡镇政府、村集体或村民，购房者的产权是由开发商的产权分割而来，且受到一定限制，例如出售通常需要在购买5年以后才能进行，且原售房单位有优先购买权。
权益保障
大产权房：购房者享有广泛而坚实的权益保障，包括自由处分房产、面临房屋质量问题或开发商违约时可以通过合法途径维护自己的权益。
小产权房：购房者权益保障较弱，由于产权不完整，可能面临房屋质量、售后保修、物业管理等多方面的问题，且在拆迁时基本不会得到补偿。
综上所述，大产权房和小产权房在合法性、交易税费、产权归属和权益保障等方面存在显著差异。大产权房受到法律保护，可以合法进行交易，而小产权房则存在法律风险，且权益保障较弱。建议购房者在购买房产时，仔细了解相关法律规定，选择合法合规的房产项目。