申请软件著作权登记的费用如下：
计算机软件著作权登记申请费 ：250元/件次。如果申请登记多种文档，每增加一种文档，增收80元。软件权利转移备案费
转让或许可：300元/件次。
继承：200元/件次。
计算机软件著作权续展费：
550元/件次。
计算机软件著作权登记证书、软件权利转移备案证书和软件著作权续展证书费：
各为50元/件。
变更或补充登记费：
150元/件次。
异议请求费：
150元/件次。
复审请求费：
150元/件次。
软件源程序封存保管费：
100页内120元，超过100页的，每增加一页增收2元。
查询费
计算机信息库查询费：
题录库查询：检索登记库中某类软件目录，最近五年信息每题100元，超过100条，每条加收0.30元；追溯查询（五年前）每题150元，超过100条，每条加收0.50元。
文摘库查询：查询某个软件的简介文摘，最近五年信息每题20元，超过3页，每页加收0.50元；追溯查询（五年前）每题30元，超过3页，每页加收0.50元。
著作权概况查询：查询某个软件著作权情况，最近五年信息每题200元，超过3页，每页加收0.50元；追溯查询（五年前）每题250元，超过3页，每页加收0.50元。
纸介质查询费：对指定登记号的档案进行查阅，每件次收费2元。如需复印加收复印费。
建议
选择申请方式：
如果时间充裕，可以选择自行申请，填写申请表并准备相关材料。如果时间紧迫或对流程不熟悉，建议委托专业的代理机构代为申请，虽然会收取一定的代理费用，但通常会更高效且省心。
准备材料：确保所有材料齐全且符合要求，包括申请表、软件源代码、使用说明书、著作权归属证明等。如果是委托代理，还需准备委托书及相关身份证明。
关注费用：在申请过程中，注意各项费用的金额和支付方式，避免出现不必要的误解或额外支出。
通过以上步骤和注意事项，可以更顺利地完成软件著作权的申请工作。