单位管理软件系统的方法可以总结如下：
安排管理人员
指定一名管理人员负责应用系统软件及其附属硬件的管理、维护和维修，以及网络管理等工作。
员工培训
对经常使用应用系统的员工进行基本操作培训，并教授一些基本问题的处理方法，以提高他们的操作能力和问题解决能力。
记录使用情况
由电脑操作人员简单记录软件的使用情况，如是否正常运行，如发现异常则及时记录并通知专业人员进行维修，避免个人擅自拆解修理。
保密管理
强调保密意识，任何人未经上级领导同意不得擅自获取相关内部数据，违反者将受到处罚。
数据备份与系统更新
定期对数据进行备份，并确保系统和设备及时更新，以保障系统的正常运行。
制定规章制度
制定相关的规章制度，并在全员进行应用系统培训后进行全面使用，以提高工作人员的规则意识。
软件统一管理
公司需用的软件由IT部门统一购买、保管，并登记造册，所有办公用电脑只允许安装经过IT授权的软件。
安装、删除和升级管理
软件的安装、删除和升级由IT部门负责，未经批准，各部门和人员不得自行操作。特殊软件的安装需要经过申请和审核，敏感软件还需总经理批准。
禁止私自安装软件
未经许可，使用者不得私自安装与工作无关的软件，由此引起的故障由个人负责。
反病毒软件与系统文件管理
不得随意关闭反病毒软件及删除C盘中的系统、软件文件，以确保系统的安全性。
版本管理和控制
对软件版本进行管理和控制，确保使用的软件版本符合要求，避免因版本不兼容导致的问题。
明确需求与目标
在管理ERP系统之前，企业需要明确其需求和目标，选择合适的ERP软件，并进行有效的实施和培训，同时持续监控和优化系统。
软件安装与保管
企业各类计算机软件由文献信息管理科统一安装保管，并进行定期盘点。各部门因业务需要需使用时可提出申请，由文献信息管理科根据授权范围进行安装，严禁个人私自安装软件。
远程管理与监控
使用远程管理工具支持远程在线操作，如远程关机、重启、注销、锁定等，以及远程安装、卸载、重启、升级客户端软件，提高管理便捷性。
安全监控
通过屏幕监控、聊天监控、网络监控、应用监控和文件监控等功能，确保员工使用软件的安全性，并防止敏感信息的泄露。
集成多种管理系统
企业越来越倾向于将CRM、OA、ERP、财务等功能集成到一个系统上进行全方位管理，以提高工作效率和管理水平。
用户账号与权限管理
建立唯一的用户账号，并开放相应的访问权限，用户需定期更改密码，以确保系统的安全性。
通过上述措施，单位可以有效地管理软件系统，确保其正常运行和安全使用。