制作化学视频的软件有以下几种推荐：
万彩动画大师
特点：简单易用、功能强大，具有丰富的模板库和素材库。适合新手老师快速上手，支持导入PPT课件进行设计，并有智能成片功能。
功能：提供学科微课相关的视频模板，可以直接拖拽图形和符号展示化学概念和实验过程，支持添加动画效果和配音字幕，还有AI配音资源。
Video Scribe
特点：操作容易，界面友好，拥有丰富的适用于中学化学课程的图像素材，可以降低制作化学动画微课的技术门槛。
Chem3D
特点：与ChemDraw配合使用，主要用于打开三维结构，并计算和预测该结构的各种性质。三维图形显示功能有限，但适合展示分子结构和化学实验装置。
根据以上推荐， 万彩动画大师因其易用性和丰富的功能，是制作化学视频的较好选择，特别适合新手老师。如果需要更专业的三维化学结构展示，可以考虑使用Chem3D配合ChemDraw。