软件单独加密的方法有多种，以下是几种常见的方式：
使用第三方加密软件
市面上有很多第三方加密软件支持对应用程序进行加密。这些软件通常通过加密软件的执行文件（.exe）或相关配置文件来实现。但需要注意的是，直接加密软件的可执行文件可能会导致软件无法正常运行，因为加密后的文件在执行时需要解密，而这一过程通常需要特定的解密器或驱动支持。一种更为常见且安全的方法是使用加密软件对软件存储的数据进行加密，而不是直接加密软件本身。例如，如果你的软件需要访问一个数据库或配置文件，你可以使用加密软件来保护这些数据文件，从而间接地保护软件的安全性。
应用程序级别的安全设置
许多现代软件都提供了内置的安全设置选项，允许用户通过密码、生物识别等方式来保护软件访问权限。这些设置通常包括登录密码、访问控制列表（ACL）、数据加密等。通过启用这些安全设置，用户可以有效地防止未经授权的访问和篡改。
虚拟环境隔离
使用虚拟化技术，在虚拟环境中运行敏感软件。通过虚拟化，你可以将敏感软件与系统的其他部分隔离开来，从而减少潜在的安全风险。在虚拟环境中，你可以设置独立的操作系统、网络配置和安全策略，以确保软件在受控且安全的环境中运行。
文件加密软件
可以使用专门的文件加密软件来加密文件。例如，域智盾软件、AxCrypt等，这些软件支持对文件、文件夹、USB驱动器、CD/DVD等进行加密和锁定。这些软件通常采用AES-256位加密标准，确保数据的安全性。
系统内置加密功能
大多数操作系统和办公软件都提供了内置的加密功能。例如，Windows系统支持对文件夹和文件进行加密，Office办公软件则可以对文档进行密码保护。这些内置的加密功能相对简单，适合对安全性要求不高的用户使用。
建议
选择合适的加密方法：根据你的具体需求选择合适的加密方法。如果需要保护整个应用程序，可以考虑使用第三方加密软件或应用程序级别的安全设置。如果只是需要保护单个文件或文件夹，可以使用文件加密软件或系统内置的加密功能。
定期更新和维护：无论使用哪种加密方法，都应定期更新和维护加密软件，确保其安全性和有效性。
备份重要数据：在加密重要数据时，建议同时备份加密后的文件，以防万一。
通过以上方法，你可以有效地单独加密软件，保护你的数据免受未经授权的访问和篡改。