去除软件的云注入通常有两种方法：
修改AndroidManifest.xml文件
通过恢复Application类的原始路径，确保应用启动时加载的是原始的Application类，从而避免云注入的影响。具体操作步骤如下：
使用MT管理器或其他工具提取软件的安装包。
在安装包中找到并打开AndroidManifest.xml文件。
查找``标签，并将其中的`android:name`属性替换为原始Application类的类名。
修改smali代码
通过修改smali代码，将继承自原始Application类的子类改为空壳代码，从而绕过云注入的恶意逻辑。具体操作步骤如下：
使用MT管理器或其他工具提取软件的安装包。
使用反编译工具（如IDA Pro、Ghidra等）反编译软件的dex文件。
在反编译结果中找到继承自原始Application类的子类，并将其代码修改为空壳代码。
建议
选择合适的方法：根据你的技术能力和工具使用情况，选择最适合你的方法。如果你对AndroidManifest.xml文件操作不熟悉，可以尝试使用修改smali代码的方法。
备份重要文件：在进行任何修改之前，务必备份原始文件，以防万一。
测试修改效果：在修改完成后，重新编译并安装软件，确保云注入问题已被成功去除。
请注意，这些方法可能存在一定的风险，建议在合法合规的前提下使用。