软件变更频繁时，可以通过以下方法来管理系统：
阶段化的变更管理
为软件产品设定明确的版本编号，每个版本应包含具体的时间表和变更冻结日期。这有助于界定哪些变更是当前版本范围内的，哪些则应留待下一版本处理。这种有序的方法能够提高开发效率，同时确保软件质量。
前期技术协议明确
在项目开始之前，确保技术协议详细描述了可以实现的功能。这有助于在项目执行过程中减少因需求不明确而导致的频繁变更。
严格的变更控制流程
设立变更控制流程，包括变更请求的提交、评审、批准及实施步骤。每个变更请求都应详细记录变更的原因、预期影响及实施所需资源。项目经理应定期审查这些变更请求，并与项目团队和利益相关者沟通，确保每个人都对变更的影响有清晰的理解。
利用项目管理工具
使用如PingCode、8Manage PM等研发项目管理工具，这些工具可以帮助团队更高效地管理变更请求，通过敏捷管理工具集成代码提交和任务管理，确保变更能够实时反映并得到适当处理。
客户参与和沟通
在敏捷项目管理中，客户的持续参与非常重要。确保客户能够在每个迭代中提供反馈，这有助于项目团队更好地理解客户的需求，减少误解和不必要的变更。
版本控制和责权分离
加强版本控制，确保每次在最新的代码基础上进行更改。同时，实施责权分离，加强对运行环境的访问控制，只允许授权的用户访问运行环境中的应用系统。
需求管理和变更策略
在项目启动阶段，进行详细的需求分析，定义基准文件的范围。在项目实施阶段，分析变更请求，对需求进行控制，减少需求的来源，过滤不合理的需求。同时，制定明确的变更策略，描述如何处理需求变更，确保变更过程可控。
通过上述方法，可以有效地管理系统中的频繁软件变更，确保项目的顺利进行和软件质量。