发现软件被侵权可以通过以下几个步骤进行：
直接对比
对被识别的软件与正版软件进行软盘内容对比，或者对比目录和文件名。如果两者完全一致，可以初步判断为软件侵权者。
安装过程对比
同时或先后对两套软件进行安装，观察安装过程中的屏幕显示，包括软件信息和使用功能键后的屏幕显示等是否相同。如果雷同，则可认定安装手段一致。
安装后目录和文件对比
安装成功后，对比安装后的目录和各文件，注意文件名、文件长度、文件建立（或修改）的时间、文件属性等。侵权软件在这些方面通常会有细微差别，但大部分文件应保持一致。
使用过程对比
对比使用过程中的屏幕显示、功能、功能键、使用方法等，特别是屏幕显示的普通文显和下拉、弹出菜单的方位、内容、选择项等。
代码对比
对软件的源代码和目标代码进行对比，检查是否存在实质性相似性。如果代码相似度高，且被告有接触过原告软件的证据，可以判定为侵权。
收集证据
收集侵权软件的购买记录、使用记录、网站链接、广告宣传等证据，以证明侵权行为的存在。
联系侵权方
在收集到足够证据后，尝试联系侵权方，要求其停止侵权行为，并赔偿损失。
技术取证
利用专业软件分析工具进行深度分析，包括软件指纹分析、系统日志审查、注册表检查、内存镜像分析和网络流量分析等，以确定是否存在未经授权的软件使用。
第三方审计工具
使用具备自动化检测和报告功能的第三方软件审计工具，快速识别出未经授权的软件使用情况。
通过上述方法，可以有效地发现软件是否被侵权，并为进一步的法律行动提供充分的证据支持。