订制软件的收费方式通常有以下几种：
固定价格：
在项目开始前，双方就项目的开发范围、功能、时间、人员等方面达成一致，确定一个固定的价格。这种收费方式适用于项目比较稳定、开发周期较短的情况。
时间计费：
根据软件定制开发项目的开发周期和开发人员的工作量来计算收费。这种收费方式适用于项目比较复杂、开发周期较长的情况。
成功收费：
在软件定制开发项目完成后，根据项目的实际效果来计算收费。这种收费方式适用于项目的效果比较明显、客户对项目的效果有较高的要求的情况。
人工成本：
软件开发需要的总人力天数乘以每天的人工单价。软件定制总费用包括开发人工费和管理费（管理费用通常是开发人工费的30%左右）。
综合费用：
包括前期咨询费、设计费、开发费、测试费、上线费以及后期的维护费。这些费用根据项目的实际情况来定，有的项目可能某些环节的费用会比较高，而有的项目则可能相对均衡。
风险收费：
根据项目的风险水平来确定收费标准。例如，对于高风险的项目，可以采用风险分担的定价方式，即根据项目的风险水平来调整收费标准。
建议
明确需求：在与软件定制公司合作前，企业应明确自身的需求，包括功能需求、技术难度、开发周期等，以便更准确地评估项目费用。
详细报价：要求软件公司提供详细的报价单，包括各项费用明细和计费方式，确保费用透明。
合同条款：在签订合同时，明确各项费用及支付方式，避免后期出现纠纷。
持续沟通：在项目执行过程中，保持与软件公司的沟通，及时反馈需求变化，以便调整项目计划和费用。
通过以上步骤，企业可以更好地控制项目成本，确保项目的顺利进行。