软件侵权的公证可以通过以下方式进行：
公证购买盗版软件
权利人与公证机关工作人员一起作为购买者购买盗版软件，并对所购软件进行封存以及对整个购买过程进行公证。这种方式在民事侵权诉讼中，如果没有相反的证据，一般都能够得到确认。
通过行政执法手段
在公证机关工作人员无法进入的侵权地点，可以通过版权局对侵权地点进行查处，对于行政执法机构已经认定的侵权行为，在没有相反证据的情况下，法院会直接认定。
申请电子证据保全
可以通过在线平台如“跑政通”进行电子证据保全，填写相关信息并根据提示上传资料。这种方式高效便捷，无需聘请律师或进行公证，大大降低了维权的成本。
屏幕录制和数据备份
使用屏幕录制软件记录下侵权的过程，如非法使用软件的界面、操作过程等，并确保录制的视频清晰、完整。同时，及时备份软件的相关数据，包括代码、文档、用户数据等，这些数据可以作为证据，证明软件的原创性和所有权。
网络监测
利用专业的网络监测工具，监测软件在网络上的使用情况，及时获取相关证据，如侵权网站的地址、侵权时间等。
委托律师调查取证
由于知识产权案件专业性较强，当事人可以委托律师进行调查取证，律师不仅具有丰富的法律知识，而且具有丰富的办案经验和熟练的诉讼技巧，能在不同的诉讼阶段为当事人作出适当的选择。
申请公证机关进行证据保全
公证机关的法定业务之一便是“保全证据”，公证证据具有推定为真的效果。在诉前，当事人能够充分运用公证机关收集、保全证据，是一个做好诉前准备的有效措施。
申请法院进行诉前证据保全
在法院监督下获取相关证据，确保证据的合法性、真实性和关联性，形成完整的证据链，以有力支持侵权主张。
法院调取证据
在诉讼过程中，可以向法院申请调取相关证据，法院会综合各种情况来确定具体的赔偿金额，以弥补权利人的损失。
在进行软件侵权公证时，建议尽量聘请专家或专业计算机软件侵权律师参与取证，增加证据的证明力，并确保取证过程的合法性、真实性和关联性，形成完整的证据链。