开源软件的保护可以从多个方面进行，以下是一些主要的方法：
版权法保护
开源软件仍然受到版权法的保护，软件作者拥有其作品的版权。如果使用者违反了开源协议的条款，软件作者可以依据协议和相关法律法规追究使用者的法律责任。
商标法保护
开源软件可以通过Linux、OSI认证商标等实现其商标法保护。这种保护方式具备侵权证据容易搜集、直接体现商业利益等优点。
专利法保护
尽管开源软件鼓励共享和合作，但在某些情况下，开源软件的某些创新也可以申请专利保护。这需要软件作者在开发过程中明确其创新点，并在适当的司法管辖区申请专利。
开源许可证保护
开源软件的许可证规定了如何使用和分发软件，包括是否可以修改源代码，是否可以将软件用于商业目的等。常见的开源软件许可证有GPL、MIT、Apache等。这些许可证是开源软件保护自身权益的重要手段。
合同保护
开源软件的许可证本身就是一种合同，它规定了用户和开发者之间的权利和义务。遵守这些条款可以保护开源软件免受未经授权的修改和使用。
安全审计和代码审查
定期对开源软件进行安全审计和代码审查，以确保其安全性。这包括使用安全的编程实践，如输入验证、错误处理等，以及配置适当的访问控制和权限管理。
技术保护措施
采用技术手段保护源代码，例如源代码加密、访问权限控制、操作记录审计等。这些措施可以有效防止源代码被窃取或滥用。
人员管理
加强对开发人员的培训和教育，提高他们的安全意识和防范能力。同时，建立完善的保密制度，明确员工的保密义务和责任，并加强对员工行为的监督和管理。
第三方安全管理软件
使用专业的第三方安全管理软件来保护源代码，例如安企神软件等，这些工具可以提供更为全面的安全保护措施。
持续监控和备份
实施持续监控机制，实时检测对源代码仓库和系统的未经授权访问或异常活动。同时，定期对源代码进行备份，确保备份数据的安全性，为数据恢复做好准备。
通过上述方法，开源软件可以在很大程度上得到保护，既保障了开发者的权益，也促进了开源生态系统的健康发展。