软件著作权的强制执行可以通过以下方式实现：
诉讼
当事人可以向人民法院提起诉讼，要求法院判令侵权方停止侵权行为、赔偿损失等。如果法院判决支持原告，但被告仍不履行判决，原告可以申请法院强制执行。
仲裁
若当事人之间存在有效的仲裁协议，且仲裁裁决已经作出，但被告不履行仲裁裁决，则原告可以申请人民法院强制执行仲裁裁决。
行政保护措施
著作权人可以向版权行政管理部门投诉，行政部门有权责令侵权人停止侵权行为，没收违法所得，没收、销毁侵权复制品，并可处以罚款。情节严重的，还可以没收主要用于制作侵权复制品的材料、工具、设备等。
刑事手段保护
对于以营利为目的，未经著作权人许可，复制发行软件等侵权行为，违法所得数额较大或者有其他严重情节的，构成侵犯著作权罪，可以依法追究刑事责任。
申请强制执行的期限
一般期限：申请法院强制执行的期限通常为两年，从相关法律文书中规定的履行期限的最后一天起开始计算。
强制执行的具体措施
财产查封、扣押、冻结：法院可以对侵权方的财产进行查封、扣押或冻结，以确保判决的执行。
拍卖、变卖：如果侵权方仍不履行判决，法院可以采取拍卖或变卖其财产的措施，以强制其履行赔偿义务。
禁止转让：法院可以裁定禁止侵权方转让其著作权中的财产权，防止其逃避执行。
建议
及时采取法律行动：在发现侵权行为后，著作权人应尽快采取法律行动，包括协商、调解、仲裁或诉讼，以维护自身权益。
保留证据：在诉讼或仲裁过程中，著作权人应妥善保留相关证据，以便在强制执行阶段提供充分的证据支持。
咨询专业律师：在处理软件著作权纠纷时，建议咨询专业律师，以获得更具体的法律建议和帮助。