要证明软件是公司的，可以通过以下几种方式：
软件著作权登记
在国家版权中心办理软件著作权登记，提交公司营业执照副本复印件并加盖公章。软件著作权登记是证明软件所有权的重要法律文件，能够初步证明软件的原创性和权属。
拥有知识产权的证明
提供软件产品登记证、计算机软件著作权登记证或专利证等知识产权证明材料。这些证书能够证明公司对该软件拥有合法的知识产权。
企业资质和财务报表
提交企业法人营业执照副本、资产负债表、损益表等财务报表，以及软件企业认定申报表。这些材料能够证明公司的合法经营和软件产品的开发、销售情况。
科研开发成本明细账
提供科研开发成本明细账，证明公司在软件研发方面的投入和成果。
人员资质
提供大专以上人员名单，证明公司具备研发软件所需的专业人才。
合同和发票
提供与用户签订的信息技术服务合同及发票，证明软件的销售和收入情况，以及软件收入占企业总收入的比例。
通过以上材料，可以全面证明软件是公司的，并且拥有合法的知识产权和经营资质。这些步骤和材料不仅能够帮助公司证明其软件产品的合法性，还能够增强公司在市场上的竞争力和信誉。