巴尔喀什湖东咸西淡的原因主要包括以下几个方面：
地理位置和气候条件
巴尔喀什湖位于中亚心腹地带，属于典型的内陆气候，降水稀少，蒸发旺盛。这种气候条件使得湖水中的盐分难以被稀释，逐渐积累形成咸水。
水体交换不畅
湖的东西两部分通过狭窄的乌泽纳拉尔湖峡相连，这使得两边的湖水交换缓慢，难以充分混合。东部缺乏淡水河流注入，而西部有伊犁河等河流注入，带来淡水，从而形成了东咸西淡的局面。
河流注入差异
伊犁河自东向西注入巴尔喀什湖的西半部，提供了该湖75%至80%的入水量，而东半部分则缺少淡水注入。尽管东半部分有数条河流汇入，但河流流量极小，无法有效稀释盐分。
蒸发与补给失衡
东部的蒸发量远大于河水的补给量，导致盐分不断积累。而西部由于有伊犁河等河流注入淡水，盐分被稀释，形成了淡水水域。
综上所述，巴尔喀什湖东咸西淡的现象是由其地理位置、气候条件、水体交换不畅、河流注入差异以及蒸发与补给失衡等多种因素共同作用的结果。