博士毕业论文的参考文献格式一般遵循 GB/T 7714-2005《文后参考文献著录规则》的标准。具体的格式要求如下：
专著
[序号]作者.专著名[M].出版地：出版社，出版年.
期刊中析出的文献
[序号]作者.题（篇）名[J].刊名，出版年 （期号）.
论文集
[序号]作者. 题（篇）名[C]. 出版地：出版社，出版年.
学位论文
[序号]作者.题（篇）名.授学位地：授学位单位，授学位年.
专利文献
[序号]专利申请者.专利题名[P].专利国别：专利号，出版日期.
标准
[序号]标准编号，标准名称[S].
报纸文章
[序号]作者.题名[N].报纸名，出版日期（版次）.
报告
[序号]作者.题名[R].保存地点：年份.
电子文献
[序号]电子文献作者.题名[电子文献及载体类型标识].文献出处，日期.
在论文正文中引用参考文献时，应使用上标形式标注在引用的文字上方，并在文末的参考文献部分详细列出。常见的引用格式有：作者姓氏（年份）式、作者姓氏（年份）页码式、作者姓氏（年份）页码范围式等。
建议：
确保所有引用的文献都是作者直接阅读过并在正文中被引用过的。
参考文献应按照其在正文中出现的先后以阿拉伯数字连续编码。
参考文献的序号左顶格书写，并用数字加中括号表示，如，,…。
每一参考文献条目的最后均以英文句号“.”结束。
参考文献与正文连续编排页码，参考文献不少于6篇。