深圳的主要港口包括：
蛇口码头
蛇口客运码头始建于1981年，是深圳最早开发建设的港区之一，位于深圳湾北部南头半岛的五湾至左炮台山之间，由招商局蛇口工业区开发建设。
福永码头
深圳机场码头（旧称：福永码头/深圳机场福永码头），位于深圳宝安国际机场西南位置，距机场T3航站楼仅2公里。
盐田码头
盐田港是中国广东省深圳市港口，位于深圳市南大鹏湾北岸，西临沙头角，西北经24千米铁路达深圳市，东至惠州72千米，南为小梅沙。
赤湾码头
赤湾港位于深圳市南山区，是一个现代化的港口，以集装箱运输和散货装卸为主，同时提供仓储、物流等配套服务。
妈湾码头
妈湾港区位于南头半岛西侧，南临赤湾港区，北至大铲湾口南侧。
此外，深圳还有其他一些较小的港区，如大铲湾、沙鱼涌、下洞、东角头等。
这些港口在深圳的经济发展和对外贸易中发挥着重要作用，提供了便捷的海上交通和物流服务。