《青春有你3》停播的主要原因包括：
选手余景天的丑闻：
热门出道的选手余景天由于诸多丑闻先后曝光，包括其父母旗下的KTV有嫌疑、拥有双重国籍的传闻以及早期发表的不当言论，引发了社会群众的热议，虽然这并不是导致节目停播的直接原因。
节目品牌商的不当操作：
节目品牌商为了卖奶进行毫无节操的操作，例如在决赛的投票规则中，要求粉丝购买节目牛奶品牌赞助商的饮料，并利用瓶盖的QR code来投票。这导致一些粉丝为帮练习生投票而购买大量饮料，喝不完只好倒掉，引起了网友的反感和官方的关注。
严重的社会影响和负面反馈：
节目录制过程中出现了选手之间的不当行为和争议性言论，这些事件引发了广泛的社会关注和批评，对节目的形象和声誉造成了严重的损害。
违反食品浪费法：
由于粉丝购买大量牛奶用于投票，喝不完便倒掉，这种行为违反了食品浪费法的规定，引起了官方媒体的注意和批评。
官方责令停播：
北京广播电视局责令爱奇艺停止录制《青春有你3》，并要求平台方完善节目管理制度，整改存在问题。
综上所述， 《青春有你3》停播的原因是多方面的，包括选手的丑闻、节目品牌商的不当操作、严重的社会影响和负面反馈以及违反食品浪费法等。这些因素共同作用，最终导致节目被停播。