氨氮超标的主要原因包括以下几个方面：
农业活动排放
农业活动中广泛使用的化肥和畜禽养殖产生的粪便是氨氮的主要来源。当这些物质进入水体后，会转化为氨氮，导致水质氨氮超标。
工业废水排放
许多工业生产过程中会产生含有氨氮的废水，如果处理不当，直接排放到水体中，会导致水质氨氮超标。
生活污水排放
生活污水中的有机物质在分解过程中会产生氨氮，如果污水处理设施不完善，会导致氨氮直接排放到水体中，引发水质问题。
曝气系统设计问题
曝气系统设计不符合规范，如供气量不足、硝化菌不够、停留时间不足等，都会影响氨氮的降解效果，导致氨氮超标。
工艺设计问题
工艺设计的设施规模过小，处理负荷太小，营养成分比例达不到设计标准等，需要外加营养投加系统，否则可能导致氨氮超标。
硝化反应条件控制不当
硝化反应没有控制好pH值、温度、溶解氧、C/N比等条件，也会影响氨氮的降解效果，导致氨氮超标。
设备故障与维护不足
污水处理设备使用时间过长老化，设施维护不当、不及时，也会影响氨氮的处理效果。
自然因素
某些地质条件或水文地质条件可能会导致地下水中的氨氮超标，例如地下水与含氨岩石接触时，可能会释放出氨氮。
其他因素
温度问题、负荷问题、毒性问题、营养问题、菌种自身优势性问题等，都可能导致氨氮超标。
综上所述，氨氮超标的原因是多方面的，涉及农业、工业、生活污水、工艺设计、设备维护等多个方面。要有效控制氨氮超标，需要从多个角度进行综合管理和处理。