血族始祖杀血族的原因主要是出于 忌惮血族的力量和存在。血族和始祖都拥有极快的速度和强大的力量，且他们的意识是互为相通的。血族还具有一个高于始祖的能力，即可以自身隔断与其它始祖的联系。这种力量和能力让始祖感到威胁，因此他选择杀死血族以消除这一潜在的威胁。
此外，血族在罗马时期寄宿在一名十多岁的少年身上，并且这个少年还是皇帝身边的大红人。血族通过吸取孕妇的血，让孕妇生下了孩子，这个孩子后来成为了血族的成员。始祖得知这名男孩的降生后，一直追杀他，而始祖想与血族对抗，最终被拒绝，也遭到了始祖的追杀。
综合来看，血族始祖杀血族的原因是为了消除血族这一强大的威胁，防止其对自己和后代造成不利的影响。