业务工作接受上级业务部门指导的单位, 保密工作以上级业务部门管理为主,同时接受上级业务部门的指导。因此,正确答案是:
业务工作接受上级业务部门的指导,保密工作也以上级业务部门管理为主。
虽然保密工作也接受地方保密行政管理部门的指导,但这并不是主要的管理主体。
综上所述,业务工作接受上级业务部门指导的单位,保密工作主要以上级业务部门管理为主,同时接受上级业务部门的指导。