金刚萨埵心咒的注音是 嗡ōng bān zhā er sa duǒ hōng。其中，“嗡”建议读作（ōng），在佛教咒语中，“嗡”和“唵”都是对古梵语“om”的译音字；“尔”读音为（er）轻声，在咒语读诵中，轻声念，一带而过；“吽”发音为（hōng轰），也有书注音为（hòng）。
建议每次念诵108遍，如果时间紧张，也可以心诚则灵，念多少遍都行，不强求。在修法时，金刚萨埵心咒被认为是非常有效的咒语，能够消除业障、获得解脱和成就。