三菱PLC编程运行频率的设置方法如下：
使用计数器指令
在三菱PLC编程软件（如GX Works3）中创建一个新的程序，并进行编程。
选择一个合适的计数器（Counter）指令，并设置运行次数。例如，将设定值设置为100，这意味着当计数器达到100时，将产生输出或触发其他操作。
如果需要设置复位功能，可以在计数器指令中配置复位条件。当该条件满足时，计数器将复位为初始值，并重新开始计数。
对计数器指令进行连接，以便在特定条件下触发相应的操作。这可以是设置输出信号、触发其他指令或控制设备的动作。
在PLC程序中的适当位置调用这个计数器指令，以确保它将被周期性地运行。可以使用周期性（或定时）中断指令来调用计数器指令，以指定运行次数的间隔。
使用定时器指令
可以使用定时器（Timer）指令来设置计数器指令的运行频率。例如，使计数器每秒递增一次，就可以在1秒的定时器指令中调用计数器。
三菱变频器的频率设置
操作面板设置：利用变频器操作面板上的上升和下降键进行频率设定。这种方法不需要外部接线，操作简单，频率设置精度高，适用于单台变频器的频率设置。
控制端子设置：
外接电位器：通过调整外接电位器的输出电压来改变变频器的频率设定值。例如，FR-500系列变频器的10端子提供标准的10V直流电压，2端子是频率设定输入端，5端子是模拟量输入公共端子。
电动电位器：利用变频器控制端子的特定功能，通过设置变频器的内部参数，使端子RH、RM成为电动电位器，从而进行频率设置。
通过通讯接口设置
如果使用CCLink通讯，可以通过PLC侧设定CCLink的RWw1字来设定频率。例如，要设30.00Hz，则往D2001里写数3000（单位是0.01Hz）。
建议
选择合适的设置方法：根据实际需求选择最合适的频率设置方法，例如，对于简单的频率调整，可以使用操作面板；对于需要高精度或远程控制的场合，建议使用控制端子或通讯接口。
参考变频器手册：在设置频率时，建议参考变频器的用户手册或技术指南，以确保正确配置和使用。