在《神武3》手游中，修改的内容主要包括以下几个方面：
战斗方面的改动
助战伙伴数量：由最多1个调整为2个，包括忍犬、姐妹、援助技能等。
门派调整：
天策：
后发制敌第一回合新增效果：受到物理攻击时有概率进行反击。
降低后发制敌第二回合攻击的速度加成。
天宫：
天威buff调整：降低对手20%防御；若己方出手比目标慢，则给敌人附加状态的概率降低为50%。
降低天眼的战气消耗。
毁天灭地不再需要消耗愤怒。
提高逆转阴阳的速度加成。
万兽：
使用狮威镇世后，延长变身状态由3回合提高为4回合。
提高凌空闪的速度加成。
魔王：
魔焰滔天增加效果：若被攻击单位处于中毒（兽决毒）/魔法毒状态，则必然会被附加魔焰滔天buff；处于魔焰滔天buff下的单位，在承受漫天狂沙伤害时，伤害结果增加10%。
龙宫：
略微提高龙隐的速度加成。
驭兽技能调整
驭兽秘籍新增特殊功效：根据驭兽秘籍的等级，增加管制宠物的气血上限，增加数值同时与宠物等级密切相关。
宠物驭兽技能大调整：
体魄：若宠物携带反震/高级反震，则反震触发概率提高，且反震伤害结果额外增加。
失忆：失忆在原有效果的基础上，还增加了对处于失忆状态的单位伤害结果额外增加的效果。
先锋：先锋的触发概率大大提升，但增加了“力量加点越少触发几率越低”的限制。
瞬闪：瞬闪这个技能同样增加了几率，满级的瞬闪现在可以让宠物在召唤的当回合，百分百不会受到对方的攻击。
乘胜：乘胜触发最高几率提升，同时删除了“非玩家对战不管是否打死，触发几率都固定为一定比例”的设定。
迁怒：新的迁怒移除了不触发护盾这个功效，但是满级迁怒在使用物理法术攻击敌人时，可以必定不触发保护。
围剿：删除了之前“同个单位多次攻击只算一次”的设置。
其他重要改动
宠物和NPC新画像：包括叶青峰、凌霜月等角色以及NPC、宠物都将拥有更加细致美丽的造型和全新的角色动作。
跨服好友系统：允许玩家跨服添加志同道合的小伙伴，积攒彼此的好友度。
新手服务器和帮派排行榜：开设新手服务器，更新帮派排行榜等相关玩法。
这些改动旨在提升游戏的平衡性、趣味性和互动性，为玩家带来更好的游戏体验。建议玩家关注这些改动，以便更好地适应新的游戏环境。