手游开发常用的编程软件主要有以下几种：
Unity
支持语言：C、JavaScript、Boo等。
特点：跨平台游戏引擎，提供图形引擎、物理引擎、动画系统等，易学易用，适用于初学者和独立开发者，也被大型游戏公司广泛应用。
Cocos2d-x
支持语言：C++。
特点：开源跨平台游戏开发框架，支持iOS、Android、Windows等平台，可以快速开发出高性能的2D游戏，提供丰富的API和工具。
Unreal Engine
支持语言：C++、蓝图等。
特点：一款强大的游戏引擎，支持高质量的3D游戏开发，具有出色的图形渲染和物理效果，广泛应用于大型游戏开发。
Godot
支持语言：GDScript、C等。
特点：一个完全免费的开源游戏引擎，易于学习和使用，支持2D和3D游戏开发，拥有活跃的社区。
LayaAir
支持语言：JavaScript、TypeScript等。
特点：一个轻量级的2D游戏开发框架，支持HTML5和原生平台，适合快速开发和跨平台部署。
此外，还有一些辅助框架和工具可以帮助开发者优化游戏性能和用户体验，例如：
Xposed框架：允许在不修改APK的情况下影响程序运行，适用于需要系统级别修改的场合。
免root虚拟框架：如纵横免root框架、熊猫框架等，支持游戏数据和框架内容的修改，方便快捷。
游戏辅助工具：如gg修改器框架、凉情辅助器等，提供多功能的修改功能，适用于各种游戏。
根据你的开发需求和技能水平，可以选择合适的框架和工具进行手游开发。如果你是初学者或者想快速开发2D游戏，可以选择Cocos2d-x；如果你想开发高质量的3D游戏，可以选择Unity或Unreal Engine。