在神武手游的后期，以下几个门派通常被认为是较为强大的选择：
武当：
作为物理输出门派，武当在后期依然表现出色，适合喜欢暴力输出的玩家。
巨阙：
同样是物理输出门派，巨阙在后期也非常受欢迎，特别是在野外PVP战斗中表现突出。
明教：
作为辅助门派，明教在后期同样有着重要的地位，适合喜欢治疗和辅助的玩家。
天策：
另一个辅助门派，天策在剧情任务和副本挑战中表现优秀，也是后期非常强力的选择。
普陀：
普陀是辅助系门派，具有强大的持续回复和法术防御能力，在后期非常吃香，特别是佛门和普陀这两个门派。
化生：
同样是辅助系门派，化生在后期也非常强大，能够提供大量的治疗和辅助效果。
魔王：
魔王在后期同样表现出色，特别是在输出方面，具有很高的潜力。
龙宫：
龙宫在后期也是一个非常强力的选择，特别是在使用双龙戏珠和龙啸九天等技能时。
大唐：
大唐在后期防御提升很大，输出也很快，封印技能100%必中，是一个非常实用的选择。
狮驼：
狮驼在后期技能多变，封印技能100%必中，虽然前期较为弱势，但后期潜力巨大。
根据以上信息，玩家可以根据自己的游戏风格和职业定位来选择最合适的门派。例如，如果你喜欢物理输出和野外PVP战斗，可以选择武当或巨阙；如果你更倾向于治疗和辅助，明教或天策可能更适合你；如果你希望选择后期依然强力的辅助门派，普陀和化生是不错的选择；而如果你想在后期追求高输出，大唐和魔王可能更适合你。