《凹凸世界》手游的故事背景设定在遭遇黑化魔兽的凹凸大赛中。在这个大赛中，玩家将扮演见习天使，与来自不同星球的参赛者并肩作战，共同探索大赛背后的真相。游戏的核心玩法结合了战斗与行动，提供了不同难度的关卡设计，使得游戏既适合新手玩家也能享受挑战。此外，游戏中还包含了羁绊系统、自定义装扮系统以及小剧场创作系统等丰富的休闲娱乐模块。
从剧情的明线来看，凹凸大赛是游戏世界观中最重要的赛事，参赛者需要在这个赛事中展现出自己的最强实力，并抵挡那些试图入侵大赛、破坏规则的黑暗势力。而玩家作为遗忘了姓名和过去的见习天使，由七神使从元力池中复活并送往凹凸大赛，负责调查魔兽异常化背后的始作俑者。在与越来越多的参赛者接触后，玩家逐渐产生了了解自身过去的愿望，但这个愿望却屡次遭到裁判球160628的制止，这其中似乎隐藏着更危险的秘密。
结合暗线剧情，可以推测出游戏的整体故事可能涉及天使与人类的命运，以及凹凸大赛的真正目的。有观点认为，天使即玩家自身可能是凹凸大赛的创始者，由于对未来末世的预知而创办了大赛，选拔出能够与暗天盟抗衡的选手共同抵御黑暗力量。在危机即将来临之际，玩家将再次出现，拯救世界于危难之中，成为救世主。
总的来说，《凹凸世界》手游的故事是一个充满奇幻与冒险的世界，玩家将在探索凹凸大赛真相的过程中，逐渐揭开自己过去的秘密，并承担起拯救世界的使命。