货车刷程序存在多方面的危害，包括但不限于以下几点：
燃油需求增加：
刷程序后，车辆可能需要使用更高品质的燃油，如从92号汽油升级到95号汽油，这不仅增加了燃油成本，还可能对发动机的运行效率提出更高的要求。
发动机超频运转：
为了适应新程序，发动机可能会进行超频运转，这会对冷却系统产生更大的依赖。如果冷却系统不足或维护不当，可能会对发动机的耐久性产生负面影响，甚至影响车辆的使用寿命和性能表现。
冷却系统压力增加：
超频运转的发动机需要更精确的温度控制，对冷却系统的依赖性显著增强。如果冷却系统无法有效散热，可能会导致发动机过热，从而造成不可逆的损害。
法律和保障问题：
4S店通常不会为非法或非官方程序引起的车辆问题提供质保。这意味着刷程序的车辆在出现故障时，车主可能需要自掏腰包进行维修，增加了维护成本和风险。
发动机使用寿命缩短：
刷程序可能会导致发动机工作在超频状态，从而缩短其使用寿命。虽然有些车辆在刷ECU后可能还能使用较长时间，但这通常是以牺牲发动机可靠性、耐用性和使用寿命为代价的。
保值率降低：
刷程序可能会影响车辆的保值率，因为车辆的整体性能和稳定性可能会受到影响。
年检难度增加：
刷程序后的车辆在年检时可能会遇到困难，需要额外支付费用才能通过。
综上所述，货车刷程序虽然可能带来短暂的性能提升，但潜在的风险和危害也不容忽视。车主在考虑刷程序时，应权衡利弊，确保在合法和安全的前提下进行，并充分了解可能带来的后果。