本科论文查重程序主要包括以下步骤：
选择查重系统
根据学校要求或个人需求选择合适的查重系统。常见的查重系统包括Turnitin、iThenticate、URKUND、知网、万方、维普等。
注册并登录
登录选定的查重系统平台，或者使用学校授权的账号进行查重。
上传论文文件
按系统提示上传论文文件，通常支持多种格式（如Word、PDF等）。
等待比对结果
系统会对论文与数据库中的文献进行比对，生成查重报告。这个过程可能需要数分钟到数小时不等，具体时间取决于论文的长度和比对范围。
查看查重结果
查重结果会显示重复率以及具体的重复部分。学生应针对重复内容进行必要的修改。
反复检测
在修改后再次上传文件，直至重复率达到学校的要求。
提交最终版本
当论文的重复率达到标准后，可以将论文提交给学校，完成整个查重流程。
建议
提前准备：确保论文已经定稿，并且格式规范，符合学校或期刊的要求。
选择可靠系统：根据学校要求选择合适的查重系统，确保查重结果的准确性和权威性。
仔细修改：根据查重报告，对论文中的重复部分进行修改和润色，降低重复率。
注意引用：确保引用内容标注了来源，不构成抄袭，并遵守学校或期刊的引用格式要求。
通过以上步骤，可以有效地进行本科论文的查重，确保论文的原创性和学术诚信。