农村合作医疗（简称合疗）的报销程序相对复杂，需要患者准备一系列材料，并通过多个环节进行审批。以下是一般的报销流程：
门诊报销
在村卫生室及村中心卫生室就诊时，若费用未超过家庭门诊账户基金余额，由定点医疗机构垫付并直接报销；若超过余额，超出部分需患者现金支付。
在镇卫生院等不同级别医疗机构就诊时，参保患者需持合作医疗证到定点医院就医，凭检查、治疗处方到门诊收费处划价。
住院报销
在市内定点医疗机构就诊时，患者可直接在窗口刷卡报销。
在市外2级及以上的公立医院就诊时，患者需在出院后3个月内携带就医资料（包括身份证、户口簿、病历复印件、住院结算单、住院费用清单、转诊备案手续）前往区服务中心报销。
异地报销时，患者需先就诊，在住院期间或出院后到县合管办补办转诊备案手续。
费用核算与兑付
县级定点医疗机构合作医疗窗口初审核算人员受理医疗费用报销申请，审查材料并核算补偿范围内的医药费用和补偿金额，填写《新型农村合作医疗住院补偿表》，并签署核算意见。
乡镇定点医疗机构由初审核算人员受理申请，经复核人员或乡镇专职审核员审核后，签署审核意见。
费用兑付由县级以下定点医疗机构合作医疗窗口兑付人员根据审核意见，向申请人支付应报销的医药费用，并由申请人或其代理人在《新型农村合作医疗住院补偿表》上签字。
其他注意事项
报销过程中，患者需提供完整的就医资料，包括病历、发票、诊断证明等。
若委托他人办理报销，需提供受托人的身份证及复印件。
对于意外伤害住院的，患者应及时在出院后15天内向乡镇医管办提出意外伤害报销申请，并提供《意外伤害补偿审批表》。
建议患者在就诊时详细了解当地合疗的报销政策和流程，确保携带齐全所需材料，以减少报销过程中的麻烦。对于异地就诊的患者，提前办理转诊备案手续尤为重要，以确保能够顺利享受到医保报销。