设计院在运营过程中需要遵循以下程序：
设计准备阶段
建筑专业调整平面方案，并交本专业总工审定。
各专业制图人确定各自专业设计方案，填写方案审定单并由各专业总工审定。
各专业反提条件，由建筑专业完善方案交付项目负责人。
项目经理编制设计任务委托书，提交各专业总工审定并补充相关内容。
项目经理将整理完整的设计任务委托书及确认的方案图交由甲方签字确认。
施工图设计阶段
施工图设计过程中某一专业如遇到牵扯其他专业的变动需填写方案审定单并报本专业总工审定，同时通知项目经理。
各专业总工应在专业角度全程监督制图人员，保证出图质量。
各专业应最大化地为甲方考虑节约造价，必要时提供多种方案供甲方选择。
审图出图阶段
各专业应做好施工图审定、审核以及校对工作，按要求填写校审记录单，制图人员逐条答复校审记录单中的各项问题。
审图工作结束后，由制图人制作出图文件（PDF格式），整理本专业的计算书。
注册流程
核名认证：向工商行政管理部门提交公司名称申请，获得公司名称预先核准通知书。
网登注册：通过北京市线上服务平台进行网上登记，填写公司相关信息并提交材料。
领取执照：等待审核通过后，领取营业执照正副本及印章等必备物品。
税务报道：到当地所属税务部门进行税务登记，并按照月、季度、年等要求时间进行申报。
银行开户：选择合适的银行办理公司账户开户，法人需到场办理。
额外资质要求
设计院在注册时，除了需要满足上述基本流程和条件外，还可能需要根据其从事的具体设计业务满足额外的资质要求。
这些程序确保了设计院的日常运营合法合规，并为其提供了清晰的工作流程和指导。