实施替代程序的原因主要有以下几点：
原计划程序无法执行
客观原因：例如，因天气变化等不可抗力因素，注册会计师可能无法执行原定的监盘程序，此时就必须寻找替代方法来获取必要的审计证据。
程序效果不足：有时，即使已经执行的程序在效果上不如预期，注册会计师也需要执行替代程序以确保审计目标的实现。
实现既定审计目标
抽样结果不可靠：在执行变量抽样测试后，如果推断的总体误差过大，注册会计师可能不再信赖抽样结果，此时需要执行更为详细的实质性测试程序以达到审计目标。
审计范围调整：当发现的错报超过注册会计师认可的程度时，例如汇总错报超过报表层重要性水平，或者涉及的舞弊、违反法规行为异常重大，注册会计师需要扩大审计范围，执行替代程序以降低整体审计风险至可接受水平。
提高审计质量和可靠性
替代程序更具可靠性：替代审计程序通常包括检查文件、询问相关人员、观察业务流程等，这些程序能够直接获取有关被审计单位内部控制和财务报告的内部信息，因此通常比函证程序更具有可靠性。
获取充分适当的审计证据：当函证程序无效时，注册会计师需要采取其他方式来获取充分的、适当的审计证据，替代审计程序能够提供更为直接和可靠的证据。
应对特殊情况
维护和改进老旧系统：当软件系统或应用程序已经存在很长时间，并且基于过时的技术或编程语言时，使用替代程序编程来重写或重新构建系统可以提高系统的性能、可维护性和可扩展性。
平台或技术迁移：当需要将一个应用程序从一种平台或技术转移到另一种平台或技术时，使用替代程序编程是一种常见的做法。
解决兼容性问题：有时，软件程序需要在不同的操作系统、浏览器或设备上运行，并且可能会遇到兼容性问题，使用替代程序编程可以解决这些问题，确保程序在不同环境下正常运行。
提高性能和效率：有些程序可能因为算法设计不当、数据结构不合理或者代码冗余而导致性能低下，使用替代程序编程可以对程序进行优化，提高性能和效率。
改进用户体验：替代程序编程可以用于改进用户界面、交互设计和视觉效果，从而提高用户体验。
综上所述，实施替代程序是为了确保审计工作的顺利进行，获取充分适当的审计证据，并提高审计质量和可靠性。在面临原计划程序无法执行或无法实现既定审计目标的情况下，替代程序能够提供有效的解决方案。