货运站建设程序一般包括以下几个步骤：
前期准备与选址
选择合适的经营场地，一般建议选择在物流园区或交通要道上，以便于货物集散和运输。
确定货运站的规模和功能，包括预计的货运量、存储能力、装卸设备等。
环境影响评价（环评）
在项目初步确定后，进行首次影响环境评估，以确保项目建设符合环保要求。
可行性研究
撰写可行性研究报告，提交铁道部初审。报告需包括线路段位、车站设置、供电等基础设施的详细规划。
铁道部同意或修改可行性报告后，初步确定线路段位及车站、供电等基础设施设置，并进行首次地质勘查。
审批与核准
最终版可行性研究报告报请国家发改委。国家发改委委托具有资质的评估机构对可研报告进行评估。
根据评估结果，国家发改委决定是否批准项目。对于大长干线如京沪高铁、京广高铁等，还需国务院审批。
获得批准与前期工作
获得批准文件后，可以进行开工准备，包括线路段位、车站、供电辅助等基础设施的微调，但不能超过发改委或国务院批准的范围。
在获得批准前，一般需要进行拆迁、征地等前期工作，并办理相关的国土批地和中铁许可。
办理相关手续
准备好所有必要的营业手续，包括工商、税务登记，以及办理货运站营业执照。
申请道路运输许可证，并进行相关的注册资本验资。
建设与运营
完成场地建设、设备采购和安装，包括电脑联网、货运单管理系统、称重设备、包装箱、铲车等。
招聘和培训相关工作人员，确保货运站正常运营。
建议在具体实施过程中，与当地政府和相关部门保持密切沟通，确保所有手续和审批流程顺利进行。