电脑在运行程序时发出声音的原因主要有以下几点：
CPU声音：
CPU在读取数据时会发出声音，尤其是在玩游戏或进行大量数据处理时，CPU读取数据和计算的过程会产生声音。
硬盘声音：
硬盘在运行过程中会转动，产生声音。运行程序会加大数据的存取速度，如果硬盘转速过快，可能会产生较大的声音。这种声音通常是由于硬盘的读盘声，如果声音过大，可能是硬盘存在问题的迹象。
风扇声音：
当程序运行时间过长，电脑内部温度升高时，风扇会启动以排热。风扇的转动会产生声音，如果风扇积尘多或润滑效果不佳，声音可能会更大。
其他硬件声音：
电脑内部的其他部件，如显卡、主板等，在运行时也可能发出声音，但这些声音通常较为轻微，不容易察觉。如果声音异常，可能是硬件故障或接触不良所致。
建议
检查硬件：定期清理风扇和硬盘，确保散热系统工作正常。如果声音异常，可能是硬件故障，需要维修或更换。
优化系统：减少开机启动项目，清理系统垃圾，确保系统运行流畅。
检查病毒：运行杀毒软件，确保电脑没有被病毒或木马感染，这可能导致程序无响应或运行缓慢。
检查硬盘：使用系统自带的硬盘扫描工具检查硬盘是否有坏道或其他问题，及时进行修复或更换。
通过以上方法，可以有效减少或消除电脑在运行程序时产生的声音，提高电脑的稳定性和性能。