申请微信小程序的费用主要包括以下几个方面：
小程序认证费
微信小程序账号注册本身是免费的，但若小程序需要使用更多功能和权限，如支付功能，则需要进行微信认证。企业、政府、媒体和其他组织类型的小程序认证费用为每年300元。个人主体类型的小程序目前无法进行认证，因此没有认证费用，但在功能上会有诸多限制。
开发费用
小程序开发费用根据功能复杂程度和开发周期等因素而定。如果自己具备技术团队，可以自行开发，只需人力成本和时间成本。若不懂技术，需要找第三方开发公司定制开发或通过SaaS搭建，费用一般在几千元到几万元不等。
服务器租用费用
小程序运行需要服务器支持，费用根据服务器配置和需求不同，一般在1500-2000元/年之间。
域名费用
域名费用较低，一般在50-100元/年之间，具体费用取决于域名后缀（如.cn或.com）。
其他费用
若需要添加特殊功能，如在线支付、客服系统、数据分析等，需要支付相应的功能费用，这些费用因功能而异，每个功能需要几千元到几万元不等。
总结来说，申请微信小程序的基本费用包括认证费300元/年、服务器租用费1500-2000元/年、域名费50-100元/年。开发费用根据具体情况在几千元到几万元不等。此外，还可能存在其他特殊功能费用和营销费用。建议根据实际需求详细评估各项费用，并进行合理预算。