负困户的基本程序包括以下几个步骤：
提出申请
由户主或申请人向户籍所在地的街道办事处或镇人民政府提出书面申请，并提供相关证明材料。对于贫困户，申请人需要持有当地常住农业户口。
初审
街道办事处或镇人民政府对申请进行初审，并将申请材料及初审意见报送县级人民政府民政部门审批。
入户调查与公示
镇政府委托村对申请人家庭进行入户调查，调查通过的上报镇。镇道对申请人家庭逐户进行实地走访审核，审核通过的，委托村进行公示，公示无异议的，报送到区民政局。
经济核对与审批
区民政局对申请人的家庭基本情况进行经济核对和调查核实，有重点地对部分申请家庭进行实地走访调查，作出审批意见。
发放生活保障金或帮扶
县级民政部门审批通过后，由县级财政部门负责发放生活保障金。对于贫困户，则制定帮扶计划，明确结对帮扶关系和帮扶责任人。
总结起来，负困户的基本程序包括：提出申请、初审、入户调查与公示、经济核对与审批、发放生活保障金或帮扶。