函证程序的作用主要体现在以下几个方面：
确认账户余额及其要素的信息：
函证程序通常用于确认或填列有关账户余额及其要素的信息，如应收账款余额、银行存款等。
确认协议、合同或交易的条款：
函证程序还可用于确认被审计单位与其他机构或人员签订的协议、合同或从事的交易的条款。
确认不存在某些交易条件：
例如，确认没有签订的合同或没有发生的交易。
提供可靠的审计证据：
恰当地设计和实施函证程序，可以为相关认定提供可靠的审计证据，同时也是应对舞弊风险的有效方式之一。
减少管理层提供不实信息的风险：
通过直接从第三方获取信息，注册会计师可以减少被审计单位管理层提供不实信息的风险。
发现潜在的错误或舞弊行为：
函证程序可以帮助注册会计师发现潜在的错误或舞弊行为。
验证信息的真实性和有效性：
在对应收账款进行审计时，函证程序可以确认账款的存在和所有权、准确性和完整性、收款能力和偿付能力、抵押和担保情况等，从而验证账款的真实性和有效性。
提高审计证据的相关性和可靠性：
函证程序的主要目的是为了提高审计证据的相关性和可靠性，降低检查风险至可接受的水平。
作为其他审计程序的补充：
函证可作为其他审计程序的补充，帮助审计师获取更全面和准确的信息，并确认客户陈述的准确性。
综上所述，函证程序在审计过程中具有至关重要的作用，它通过获取第三方的独立证据，可以提高审计的可靠性和准确性，发现潜在错误和欺诈行为，确保审计报告的准确性和可信度。