正当程序主要通过以下方式保障：
权力制约：
正当程序通过设置权力制约机制，防止公权力的滥用和恣意行为，从而保障个人和组织的合法权益不受侵犯。
权利本位：
正当程序强调权利本位，要求行政机关在行使权力时，必须尊重和保护个人的基本权利，如知情权、参与权和辩护权。
公开、公正、公平：
正当程序要求所有法律程序必须公开、公正、公平，确保各方当事人有机会表达自己的意见和进行陈述，避免暗箱操作。
参与原则：
正当程序强调当事人的参与，要求行政机关在作出重要决定前，必须给予当事人充分表达意见和进行陈述的机会。
程序法定：
正当程序要求公权力的行使必须符合法律规定的程序，形式上受到法定程序的制约，确保程序的合法性和正当性。
程序正义：
正当程序注重实质上的正义，要求权利被干预者有获得被告知、听审并辩护的权利，保障程序的公平性和合理性。
对权力的约束和控制：
正当程序通过各种机制对权力进行约束和控制，防止权力滥用，保护公民免受不公正对待。
解决纠纷：
正当程序通过提供公正的程序，帮助当事人解决纠纷，维护社会秩序和公平正义。
综上所述，正当程序通过权力的制约、权利本位、公开公正、参与原则、程序法定、程序正义、对权力的约束和控制以及解决纠纷等多种方式，保障个人和组织的合法权益，实现社会的公平正义。