查账的合法程序如下：
提出书面请求
股东应向公司提出书面的查账请求，而不能仅通过口头告知。
请求书中应详细说明查账的目的、会计账簿的起止日期等。
公司审查
公司在收到股东的书面请求后，应在十五日内进行实质性审查。
公司有权以股东查账目的不正当为由拒绝提供查阅，但必须说明理由。
拒绝查阅的处理
如果公司拒绝提供查阅，股东可以请求人民法院要求公司提供查阅。
在紧急情况下，股东可以申请法院对公司账簿采取诉讼保全措施。
法院诉讼
股东在书面的查账申请遭拒或十五日届满公司未书面回复后，可以起诉公司，请求法院要求公司提供查阅。
起诉时，股东应提供证明查账目的正当的资料、查账申请书、邮寄凭证、公司的签收凭证、公司的书面拒绝通知等证据。
其他特定情况
一般纳税人注销前需要接受财务和税务审查，税务机关会检查公司过去三年内的账本、发票、财务报表等资料。
监事查账时，需向公司提交书面的查账申请，公司应在十五日内书面答复。
税务局查账时，会检查纳税人的账簿、记账凭证、报表和有关资料。
通过以上程序，股东或相关方可以依法进行查账，确保公司财务的透明和合法。建议在查账过程中保留所有相关文件和记录，以便在需要时提供证据。