案件适用普通程序的原因主要有以下几点：
普通程序的基础性：
普通程序是民事诉讼法规定的人民法院审理第一审民事案件通常所适用的程序，也是民事案件的当事人进行第一审民事诉讼通常所遵循的程序。它具有独立性，不依赖于其他程序而独立存在，同时也是第二审程序或审判监督程序得以进行的前提，因此是诉讼中审判程序的基础。
普通程序的完整性：
普通程序包括了当事人起诉、法院受理、审理前准备、开庭审理、裁判等各个法定诉讼阶段，每一个诉讼阶段按顺序相互衔接，体系完整，反映了审判活动和诉讼活动的基本规律。此外，普通程序对各个诉讼环节的具体内容均作出了具体明确规定，并且对一些必要的诉讼制度也作出了规定，如撤诉、缺席判决、诉讼中止和诉讼终结等。
普通程序的广泛适用性：
普通程序适用于各级各类法院审理诉讼案件。中级以上的法院和各专门法院审理第一审民事案件，必须适用普通程序；基层法院除审理简单民事案件适用简易程序和小额诉讼程序外，审理其他案件也必须适用普通程序。同时，由于普通程序完整、系统，可广泛适用于法院审理一审民事案件、上诉案件和再审案件。
普通程序的独立性：
适用普通程序审理民事案件，除贯彻民事诉讼法总则部分的基本原理、基本制度外，不需要适用其他任何一种诉讼程序的规定。它是不依赖简易程序、第二审程序、审判监督程序的独立的诉讼程序。法院无论是审理一般的诉讼案件，还是重大、复杂的诉讼案件，都可以只适用普通程序就将其审结。
普通程序的适用情形：
普通程序适用于没有特殊要求的民事案件，审理案件都是普通程序。如果案件事实清楚、权利义务关系明确、争议不大，可以适用简易程序。但在普通程序中，如果发现案件属于民事权益争议，应当裁定终结特别程序，并告知利害关系人可以另行起诉。
综上所述，普通程序因其基础性、完整性、广泛适用性、独立性和适用情形的规定，成为人民法院审理第一审民事案件通常所适用的程序。