部队军人休病假的程序如下：
就医与诊断
部队工作人员患病或受伤，不能坚持正常上班时，需要到县以上医疗机构进行诊断，并由该机构出具病休证明。
申请病假
得到病休证明后，军人或其家属需要向所在单位提交病假申请，说明病情及休假时间。
单位批准
所在单位收到病假申请后，会进行审核，并根据实际情况决定是否批准病假。一旦批准，军人便可开始休病假。
病假期间的待遇
病假期间，军人可以享受相应的工资待遇。具体待遇根据病假时长和军人的工作年限而定。例如，病假在2个月以内的，发给本人基本工资或固定工资；超过2个月不满6个月的，第3个月起，工作年限不满10年的发给本人基本工资的90%等。
建议：
军人及其家属应确保提供的医疗机构诊断证明真实有效，以便顺利获得病假批准。
所在单位应严格按照规定程序审批病假，确保军人权益得到保障。