拼多多平台上的企业店铺和个人店铺有以下主要区别：
保证金
个人店铺需要缴纳2000元的保证金，而企业店铺一般只需要缴纳1000元保证金。具体金额可能会根据店铺的类目有所不同。
提交入驻的材料
个人店铺需要提供个人身份证原件正反面、个人近照及手持身份证的近照，无需提交营业执照全套资料、对公账户许可证、品牌商标注册证或商标受理书。
企业店铺需要提交营业执照全套资料，包括营业执照注册号、组织机构代码、纳税人识别码、统一社会信用代码等，并且需要提供品牌商标注册证或商标受理书。
店铺命名要求
个人店铺名称不允许重复，且不能使用“拼多多特许”、“拼多多授权”等词汇，也不能使用“旗舰”、“专卖”、“专营”、“官方”、“直营”、“官方认证”、“官方授权”、“知名品牌名”等词汇。
企业店铺如果使用“旗舰”、“官方”等词汇，必须上传商标注册证明；如果使用“旗舰”、“专卖”、“专营”，必须上传品牌授权或独占授权证明。
官方扶持力度
企业店铺通常能获得更多的曝光率和官方扶持力度，平台在活动报名时会优先考虑企业店铺。
经营主体与法律地位
个人店铺的注册主体为自然人，不具备独立的法人身份，经营行为及责任由个人承担。
企业店铺的注册主体为法人，拥有独立的法律地位和责任，能够享受法人资格的保护，并在法律纠纷中承担有限责任。
经营范围与商品选择
个人店铺适合小规模经营和个人创业，主要面向个人买家出售二手商品、自制产品等。
企业店铺可以经营更广泛的商品种类，包括批发、零售等多个领域，拥有更广泛的商品选择和更稳定的供货渠道。
根据以上区别，商家可以根据自身的经营规模、品牌影响力、资源条件等因素，选择适合自己的店铺类型。如果有公司营业执照，建议开设企业店铺，因为企业店铺在平台上的权重较高，能够获得更多的曝光和扶持。如果是个体经营者或初创企业，个人店铺也是一个不错的选择，门槛较低，适合小规模经营。